武漢病毒的基因報告(一)

作者:malfoy

武漢市衛生委員會(WHO)於2019年12月30日首次報告了中國湖北省武漢市濃縮性肺炎病例。疾病預防控制中心(CDC)和中國衛生當局後來確定並宣布,一種新的冠狀病毒(CoV)引起了武漢市的肺炎爆發。來自多個群體的科學家從住院病人身上獲得了病毒樣本。在電鏡下觀察到分離的病毒形態相同。

武漢冠狀病毒的一個基因組序列(WH-Human_1)於2020年1月10日發布,隨後又發布了五個額外的武漢冠狀病毒基因組序列。目前的突發公共衛生事件在一定程度上與2003年中國爆發的SARS疫情類似。

在當前爆發的公共衛生事件中,當務之急便是了解武漢冠狀病毒的來源和原寄主,並評估這種新型冠狀病毒在跨物種或人與人之間傳播的公共健康風險。為了解決這些與武漢爆發的病原體有關的重要問題,我們首先將武漢冠狀病毒的基因組序列與已知感染人類的基因組序列進行了比較,即SARS冠狀病毒和中東呼吸綜合徵冠狀病毒(MERS)冠狀病毒。再將兩種病毒基因組相對比發現,作為武漢冠狀病毒代表的WH-human_1基因組與SARS-CoV的基因組具有更好的同源性。

為了了解武漢冠狀病毒的起源及其與其他冠狀病毒的親緣關係,專家對來自不同來源的冠狀病毒序列進行了系統發育分析。結果表明,武漢冠狀病毒屬於betacornavirus屬。 Betacoronavirus是一種被包裹的單鏈RNA病毒,可感染野生動物、畜群和人類,導致偶爾暴發,更常見的是無明顯症狀的感染 。根據武漢冠狀病毒獨特的系統發育位置,它們很可能與SARS/SARS樣冠狀病毒(一種類似蝙蝠冠狀病毒HKU9-1的共同祖先)共有。此類病毒在它們的進化過程中存在頻繁的基因重組事件 ,這可以從它們的基因組之間的高同源序列的片段中得到證明。

總的來說,武漢冠狀病毒與人類感染SARS冠狀病毒之間有相當大的遺傳距離,與MERS冠狀病毒的遺傳距離更大。這一觀察結果提出了一個重要的可能,即武漢冠狀病毒採用了與SARS冠狀病毒或MERSCoV用於跨物種/人類傳播相同的機制,或涉及一種新的、不同的傳播機制。

(文章內容僅代表作者觀點)

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