重磅!新冠病毒發源地或不是華南海鮮市場,中國科學家通過構建新冠病毒的“家譜”,從遺傳和進化的角度找到了證據

導讀:這是一篇昨天突然出現在網絡的學術論文。根據文章介紹,來自中科副研究員郁文彬2月21日提交到ChinaXiv (中科院科技論文預發布平台)的英文論文。文章直接打臉武漢P4病毒研究所研究員石正麗,突然承認武漢病毒並非來自海鮮市場。劇情的轉換頗令人有些措手不及。石正麗是直接參與者,對於病毒的了解難道不比郁文彬更清楚嗎?是什麼令她第一時間做出引向海鮮市場的反應?又是誰讓郁文彬在全世界基本定論為人為製毒的節骨眼上否認海鮮市場的?中共的黑幕永遠深不見底,我們唯一知道的是,石與鬱都是中共培養的科學家,他們尊重的是上級而不是科學,他們服從的政治而不是真理。

無論如何,這個時間點上放出該論文值得玩味。這裡,且將原文奉上。

中國科學家在尋找新冠肺炎的發源地上,取得了突破性進展。

來自中國科學院西雙版納熱帶植物園的郁文彬副研究員,聯合華南農業大學和北京腦科中心的科研人員,在中國科學院科技論文預發布平台ChinaXiv上發表重要研究論文******[0]** ****。

通過遺傳學分析方法,郁文彬等發現,華南海鮮市場的新冠病毒應該是從其他地方輸入的。換句話說,華南海鮮市場不是新冠病毒的發源地。不過,華南海鮮市場應該是新冠肺炎的引爆點。

他們還認為,新冠病毒可能在11月中下旬就在武漢廣泛傳播了。還有個好消息是,與SARS病毒和MERS病毒相比,新冠病毒的變異較低。

論文首頁

那麼中科院的科學家是如何破解謎團,得到上述結論的呢?

我們都知道,自從新冠肺炎在武漢爆發之後,科學家和醫生紛紛猜測,華南海鮮市場就是新冠肺炎的源頭。在2020年元旦,華南海鮮市場被關閉。

不過,武漢金銀潭醫院的黃朝林教授及其同事,1月24日在頂級學術期刊《柳葉刀》上披露的首批41名新型冠狀病毒感染者的相關信息********** **[3]************,挑戰了上述假設。

在這41名首批確診患者中,有13名患者不曾去過武漢華南海鮮市場。

更重要的是,最早發病的那名患者,在2019年12月1號就發病了,他沒有去過武漢華南海鮮市場。而且,在12月10日第二批發病的3名患者中,也有2人沒有去過武漢華南海鮮市場。

這意味著,最早感染武漢新型冠狀病毒的患者,可能是在其他某個不為人知的地方被感染的******[2]** ****。

新冠病毒圖(圖源:NIAID-RML)

然而,華南海鮮市場已然關閉,目前的患者臨床表現也表明,有很多新冠病毒感染者沒有任何症狀,因此,想從流行病學的角度分析新冠肺炎的發源地,幾乎是不可能完成的事情。

隨著新冠病毒的基因組數據越來越多,從遺傳進化的角度溯源就變得可能了。

遺傳學家可以通過新冠病毒的基因組信息,摸清不同新冠病毒之間的進化或親緣關係。搞清楚誰是爸爸,誰是爺爺,誰是孫子,然後就可以給新冠病毒繪製個家譜了。

有了新冠病毒的家譜,我們就可以找到新冠病毒的祖先,然後循著這條證據線,就有望找到新冠病毒的發源地。

新冠病毒圖(圖源:NIAID-RML)

郁文彬等首先收集了世界各地科學家共享到GISAID EpiFluTM數據庫中的93個新型冠狀病毒樣本的基因組數據。

初步分析發現,這93個新冠病毒中有140個位點的變異,其中120個位於基因編碼序列中。基於此,他們將這些新冠病毒分成58種單倍型(可以簡單的理解為是58個不同的新冠病毒)。

結合其他數據之後,他們發現與SARS病毒和MERS病毒相比,新冠病毒的變異較低。換句話說就是:當前新冠病毒還比較穩定。這可能是因為,新冠病毒相對比較溫和,免疫系統沒有給它們施加太大的壓力。

變異位點分析

接下來就是最重要的分析過程:分析這58個單倍型之間的進化關係,也就是繪製它們的家譜。

我這裡就直接放圖了,下面的圖就是這58個新冠病毒的家譜。

新冠病毒不同單倍型的進化關係圖譜

上面那種圖乍一看很複雜。我們先看右邊的那個樹杈一樣的東西。

你可以明顯看到它是由三部分組成,最上面的A組呈淺綠色,是一隻腳的形狀;中間淡紫色的B組是長方形;下面的C組沒有背景色,一圈小圓圈圍著一個大圓圈;D組和E組分別從C組的左右伸出一角。

也就是說,這58個新冠病毒的單倍型(編號為H1-H58)被分成了A、B、C、D、E五個組。他們的關係是,A組最古老,可以說是新冠病毒的祖先了,越往後輩分越低。這是個大概的情況。

然後,我請大家注意A組中的H13,B組中的H38(粉紅色)和H3(四色圓餅),還有C組中的H1(最大的那個多色圓餅)。你甚至可以忽略掉上述幾個單倍型周圍所有的小圓圈,把它們四個單獨拎出來看。

為了便於大家結合文字看圖,我再放一次這張關鍵的圖

這樣的話,你就很容易發現兩條簡化路線:H13→H3→H1,以及H38→H3→H1。我們可以簡單地認為這兩條線就是祖孫三代之間的關係。 H13和H38最古老,H3居中,H1最年輕。研究人員也認為,通過系統發育網絡,基本可以認為H13和H38是新冠病毒的祖先單倍型。

不過研究人員也不排除還存在其他古老的單倍型,因為最早的感染者和12月初那部分感染者的數據,不包括在本研究之內。

新冠病毒兩條可能的進化路徑圖

接下來我要告訴你的是,來自武漢華南海鮮市場的新冠病毒都是H1及其後代(H1周圍那一圈),沒有H13和H38;甚至整個武漢的樣本中只出現了一個H3,而且與華南海鮮市場沒有關係。

那麼更古老的、爺爺輩兒的H13和H38是從哪裡的患者體內分離的呢?

H13出現在了5個深圳患者體內,他們也是廣東首批確診感染者。而H38則來自美國首例確診患者。他們的旅行記錄表明,他們在2019年12月底至2020年1月初疫情爆發期間都到過武漢,但沒有華南海鮮市場暴露史。

這說明,深圳那5名H13感染者和美國的H38感染者身上的病毒,有可能是通過武漢的醫院或者其他不明渠道感染的。

新冠病毒不同單倍型的地理分佈圖

基於以上數據,郁文彬等認為,其他科學家的猜測應該沒錯,華南海鮮市場的新冠病毒是從其他地方輸入的。

不過,研究人員還是非常期待能有早期感染者的樣本可供分析,說不定可以從這些患者體內找到H13和H38的踪跡,這對於尋找新冠病毒的發源地非常重要。

希望武漢哪家醫院裡還保存著某個不為人知的早期患者的樣本。

參考資料:

[1]. https://eprint.las.ac.cn/abs/202002.00033

************[3]************. https://www.thelancet.com/ journals/lancet/article/PIIS0140-6736(20)30183-5/fulltext

******[2]******. https://www.sciencemag.org/news/2020/01/wuhan-seafood-market- may-not-be-source-novel-virus-spreading-globally

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